卧虎藏龙作为一款经典的武侠题材游戏，其武功系统设计丰富且层次分明，主要分为内功和外功两大体系。内功侧重提升角色的气血与内力，直接影响生存能力和技能释放的持久性；外功则专注于攻击与防御属性，决定战斗中的输出效率和承伤能力。玩家可通过向江湖中的武学大师、门派师傅或传承人学习新武功，或使用秘籍、特定道具强化现有武功等级。不同武功需搭配对应资源，强化策略需根据战斗需求谨慎选择。武功的多样性为玩家提供了高度自由的战斗风格定制空间。
装备强化是武功体系的延伸，武器强化可提升攻击力与命中率，防具强化则增强防御与闪避属性。游戏中的装备可通过购买、打造或击败敌人获取，强化需借助特定NPC如强化师傅或秘密商人，后者还可能提供稀有强化道具。隐藏于江湖各处的秘籍与宝物是强化的重要资源，探索地图并完成特殊任务、成就是获取这些资源的主要途径。装备与武功的协同强化是角色成长的核心逻辑。
轻功系统是卧虎藏龙的特色玩法，分为四段进阶：一段身轻如燕默认解锁，二段踏雪无痕需20级后完成跳箱子任务，三段追云逐月和四段逍遥无极则需通过野外拓碑或副本掉落获取。轻功不仅提升移动效率，还能在战斗中实现立体化位移，配合武功招式形成独特连招。不同门派的轻功动作与特效各有差异，如明教的火焰轨迹或逍遥派的云气环绕，进一步丰富了视觉表现与战术选择。
门派武学是武功系统的另一支柱，游戏包含武当、丐帮、逍遥、明教、五毒、天龙六大门派，各派武学风格鲜明。武当以剑气远程攻击见长，丐帮侧重近战棍法，逍遥派善用扇舞与御气，明教则以斩马刀刚猛输出为主。玩家可通过提升门派职位（分文职与武职）解锁高阶武学，掌门挑战赛获胜者更能获得专属武学和时装。门派任务、势力对抗等玩法深度融入武学成长体系，强化了江湖代入感。
特殊技能与隐藏武学为高端玩法提供深度，如血练两次机制允许玩家在血量恢复后二次强化属性，但需消耗铜钱、练气丹等资源并承受临时属性削弱。药王职业的治疗效果可通过提升等级、技能、装备及武魂激活来优化，战斗中需精准判断治疗优先级与走位。奇遇任务触发的北冥真气、古琴挂件等隐藏武学，往往需要解谜或特定道具组合，为探索型玩家提供额外挑战。
卧虎藏龙的武功系统通过基础设定、门派差异、轻功联动和隐藏内容构建了立体化武侠体验。玩家需平衡资源投入与战斗定位，逐步掌握武功强化、装备搭配与战术运用的复杂关系，最终在开放江湖中成就独特的武侠之道。
