舰队编组的核心在于合理分配指挥值与舰船定位。一支舰队最多拥有300指挥值（升级后可提升至400），舰船位置分为前排、中排和后排，敌方会优先攻击前排。舰船位置由蓝图中的定位决定，无法手动调整。建议在创建舰队时起一个具有迷惑性的名字，比如将主力舰队命名为炮灰舰队，既能快速识别，也能在PVP中干扰对手判断。舰队属性界面可查看火力、舰船构成等详细信息，这些数据是调整编组的重要参考。
护卫舰中的澄海级、雷里亚特隐身型适合前期开荒，造价低且性能稳定；驱逐舰中的阋神星L级凭借定制火炮和高闪避成为中前期过渡的优质选择，活动获取难度低且能快速成型。载机舰如谷神星支援型是奶船中的佼佼者，但抽卡需要运气。大船如战巡和航母虽火力强劲，但建造耗时长且易被小船围攻，需搭配护卫舰保护。能量武器如红宝石离子炮能无视护甲，在面对装甲型敌人时优势明显。
舰队强化离不开技术点分配与战术搭配。装甲型舰船优先点满护甲和能量抗性，侦察舰则拉满动力系统；输出舰的技能顺序一般为策略＞冷却＞暴击＞伤害。维修船在对抗NPC时有用，但PVP中治疗量往往跟不上伤害。高速驱护队适合侧翼包抄，核心思路是利用650以上移速绕后；主力舰队则需前排抗伤，中后排配置大帝级巡洋舰或载机舰提供火力。注意舰队速度由最慢舰船决定，增援时避免加入龟速舰拖累机动性。
委托任务是资源获取的关键途径，分为货物搬运、救援等五种类型。科研任务建议选择邻近的采集点节省燃料；救援类需提前评估敌方实力，避免接取超难度委托。每日任务刷新后优先选择与舰队技能匹配的类型，比如载机舰多的队伍适合狩猎无人机敌人。货物重量会影响移速，运输前需权衡效率与耗时。活跃参与委托能稳定提升实力，但要注意每日奖励次数限制。
实战中地形和舰队分工能弥补战力差距。利用小行星稀疏区阻挡大船追击，或躲入高能辐射区规避小船骚扰。建议组建两支舰队：主力队侧重正面推进，配置高防前排与持久火力；机动队专注高速包夹，以刺水母、澄海级等高攻护卫为核心。攻城舰可单独编组偷袭敌方基地，消耗对手策略值。防空舰优先编入机动队，针对性拦截敌方载机。没有绝对最强的舰船，只有根据战场形势的动态调整才能制胜。
